More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0395 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.03 
 
 
668 aa  864    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.12 
 
 
674 aa  864    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.27 
 
 
674 aa  861    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  79.34 
 
 
672 aa  1111    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.6 
 
 
663 aa  1038    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.79 
 
 
668 aa  880    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.73 
 
 
668 aa  860    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.53 
 
 
619 aa  653    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.66 
 
 
668 aa  1053    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.8 
 
 
659 aa  777    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.44 
 
 
663 aa  1036    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.29 
 
 
663 aa  1033    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.73 
 
 
668 aa  861    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.04 
 
 
662 aa  1023    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.62 
 
 
631 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.57 
 
 
618 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  83.13 
 
 
662 aa  1152    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.11 
 
 
614 aa  662    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.18 
 
 
666 aa  877    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.84 
 
 
605 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.88 
 
 
669 aa  865    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.73 
 
 
668 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.48 
 
 
668 aa  875    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.48 
 
 
668 aa  875    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.97 
 
 
666 aa  857    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.79 
 
 
669 aa  878    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.73 
 
 
668 aa  862    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 
661 aa  1372    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.58 
 
 
669 aa  865    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.57 
 
 
667 aa  788    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.79 
 
 
619 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.18 
 
 
668 aa  874    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  81.61 
 
 
662 aa  1140    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.54 
 
 
679 aa  850    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.87 
 
 
612 aa  678    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.88 
 
 
669 aa  865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.73 
 
 
668 aa  866    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.88 
 
 
669 aa  865    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  51.11 
 
 
595 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.33 
 
 
584 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.74 
 
 
585 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.65 
 
 
596 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.03 
 
 
596 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.04 
 
 
596 aa  357  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.33 
 
 
566 aa  352  1e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.72 
 
 
596 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.64 
 
 
581 aa  350  4e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.06 
 
 
595 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.27 
 
 
612 aa  350  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.38 
 
 
605 aa  349  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.21 
 
 
605 aa  349  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.38 
 
 
605 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.21 
 
 
605 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.97 
 
 
582 aa  347  6e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.2 
 
 
598 aa  346  8e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.25 
 
 
598 aa  345  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.13 
 
 
596 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.39 
 
 
566 aa  345  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.79 
 
 
612 aa  344  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.29 
 
 
581 aa  343  4e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  38.04 
 
 
568 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.57 
 
 
567 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  37.94 
 
 
647 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.59 
 
 
593 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.31 
 
 
604 aa  340  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.25 
 
 
598 aa  339  9e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  35.63 
 
 
638 aa  339  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.77 
 
 
607 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.6 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.42 
 
 
595 aa  338  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.5 
 
 
567 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.23 
 
 
611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
588 aa  337  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.54 
 
 
579 aa  337  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
607 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.54 
 
 
608 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.77 
 
 
611 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.38 
 
 
608 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.17 
 
 
604 aa  333  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.27 
 
 
617 aa  332  9e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  37 
 
 
570 aa  332  1e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.01 
 
 
568 aa  332  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.77 
 
 
607 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 
596 aa  332  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.71 
 
 
566 aa  332  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.95 
 
 
588 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.95 
 
 
588 aa  331  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
588 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  37.11 
 
 
637 aa  330  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.04 
 
 
578 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 
575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.74 
 
 
583 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 
575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
588 aa  330  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.65 
 
 
575 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.32 
 
 
607 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  35.92 
 
 
573 aa  329  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.5 
 
 
603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.93 
 
 
575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>