More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0433 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.76 
 
 
668 aa  840    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  77.38 
 
 
662 aa  1089    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.91 
 
 
674 aa  841    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.81 
 
 
667 aa  795    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.85 
 
 
663 aa  1373    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.85 
 
 
605 aa  663    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.22 
 
 
668 aa  848    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.68 
 
 
659 aa  761    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.61 
 
 
668 aa  839    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.02 
 
 
614 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.46 
 
 
669 aa  835    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.45 
 
 
662 aa  1051    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.97 
 
 
666 aa  856    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.66 
 
 
631 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  52.73 
 
 
618 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.46 
 
 
669 aa  835    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  74 
 
 
672 aa  1040    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.76 
 
 
674 aa  839    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  73.44 
 
 
661 aa  1036    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.12 
 
 
668 aa  1310    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.46 
 
 
668 aa  838    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.61 
 
 
669 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.46 
 
 
669 aa  835    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.28 
 
 
668 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.28 
 
 
668 aa  853    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.76 
 
 
666 aa  837    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.46 
 
 
669 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.13 
 
 
619 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.61 
 
 
668 aa  837    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.28 
 
 
668 aa  856    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  76.77 
 
 
662 aa  1092    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.67 
 
 
679 aa  842    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
663 aa  1375    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.22 
 
 
668 aa  843    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.65 
 
 
612 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.55 
 
 
663 aa  1369    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.76 
 
 
668 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  51.39 
 
 
619 aa  630  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.75 
 
 
595 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.98 
 
 
584 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.62 
 
 
596 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.74 
 
 
566 aa  362  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.29 
 
 
585 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.91 
 
 
596 aa  352  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.11 
 
 
596 aa  352  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.48 
 
 
605 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.73 
 
 
579 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.96 
 
 
596 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.99 
 
 
605 aa  346  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  36.41 
 
 
638 aa  346  8e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  36.97 
 
 
568 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.54 
 
 
598 aa  341  2e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.5 
 
 
605 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.28 
 
 
566 aa  340  4e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.5 
 
 
605 aa  340  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.63 
 
 
596 aa  340  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 
581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  37.21 
 
 
647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.46 
 
 
611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.15 
 
 
612 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.54 
 
 
582 aa  336  9e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.48 
 
 
592 aa  336  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
589 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
589 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.51 
 
 
598 aa  335  2e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.18 
 
 
608 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37 
 
 
611 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.81 
 
 
568 aa  333  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.42 
 
 
598 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66251  succinate dehydrogenase  36.19 
 
 
641 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.26 
 
 
598 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
607 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
588 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.05 
 
 
591 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  36.52 
 
 
573 aa  331  3e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.05 
 
 
591 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.05 
 
 
591 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36 
 
 
598 aa  330  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.89 
 
 
608 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.05 
 
 
591 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.05 
 
 
591 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.05 
 
 
591 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.58 
 
 
598 aa  330  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.54 
 
 
567 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.61 
 
 
595 aa  329  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.25 
 
 
604 aa  329  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.83 
 
 
607 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.92 
 
 
542 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1776  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.82 
 
 
584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.5 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.99 
 
 
592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.54 
 
 
607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.8 
 
 
588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.88 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>