More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3552 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.09 
 
 		 646 aa  831    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.84 
 
 		 637 aa  851    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.93 
 
 		 647 aa  852    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.28 
 
 		 636 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.66 
 
 		 643 aa  1040    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.98 
 
 		 637 aa  887    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.41 
 
 		 652 aa  872    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.68 
 
 		 735 aa  1058    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.61 
 
 		 637 aa  851    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.83 
 
 		 646 aa  1089    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.67 
 
 		 636 aa  869    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.52 
 
 		 638 aa  849    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.58 
 
 		 642 aa  994    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.04 
 
 		 679 aa  895    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  71.67 
 
 		 642 aa  944    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.8 
 
 		 637 aa  904    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.15 
 
 		 637 aa  890    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.53 
 
 		 638 aa  795    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.05 
 
 		 646 aa  825    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.88 
 
 		 638 aa  776    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.35 
 
 		 646 aa  830    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.5 
 
 		 639 aa  759    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.36 
 
 		 662 aa  866    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.84 
 
 		 637 aa  844    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  73.8 
 
 		 648 aa  998    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.17 
 
 		 657 aa  901    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.37 
 
 		 635 aa  774    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.67 
 
 		 656 aa  912    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.98 
 
 		 636 aa  870    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.15 
 
 		 638 aa  880    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.25 
 
 		 645 aa  915    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.87 
 
 		 659 aa  894    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.3 
 
 		 638 aa  885    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.37 
 
 		 638 aa  839    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.24 
 
 		 644 aa  878    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.89 
 
 		 637 aa  934    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.64 
 
 		 649 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69 
 
 		 654 aa  914    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.8 
 
 		 645 aa  909    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.67 
 
 		 666 aa  899    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.61 
 
 		 637 aa  852    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  72.14 
 
 		 646 aa  942    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.3 
 
 		 638 aa  885    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.82 
 
 		 643 aa  1047    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.83 
 
 		 657 aa  925    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.79 
 
 		 638 aa  840    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.79 
 
 		 658 aa  878    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.34 
 
 		 640 aa  872    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 672 aa  1392    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  62.09 
 
 		 639 aa  797    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.93 
 
 		 646 aa  853    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  73.34 
 
 		 646 aa  980    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  79.48 
 
 		 648 aa  1081    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.98 
 
 		 656 aa  918    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.98 
 
 		 636 aa  872    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.93 
 
 		 664 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  66.52 
 
 		 667 aa  916    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.3 
 
 		 638 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.73 
 
 		 637 aa  868    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.85 
 
 		 597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.85 
 
 		 597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  353  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  353  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.62 
 
 		 597 aa  353  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 		 585 aa  353  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 		 597 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 		 597 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.21 
 
 		 586 aa  349  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.24 
 
 		 585 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 		 593 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.01 
 
 		 588 aa  323  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.75 
 
 		 585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.87 
 
 		 578 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.07 
 
 		 625 aa  309  9e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  32.98 
 
 		 568 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.22 
 
 		 598 aa  225  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.6 
 
 		 598 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.29 
 
 		 598 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.71 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.38 
 
 		 598 aa  215  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.98 
 
 		 575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.98 
 
 		 575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.04 
 
 		 606 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.33 
 
 		 599 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.34 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.69 
 
 		 607 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.69 
 
 		 607 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.69 
 
 		 607 aa  211  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  28.57 
 
 		 596 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.41 
 
 		 596 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  29.51 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.51 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.51 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  29.51 
 
 		 602 aa  207  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>