More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1825 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1825  secretory protein  100 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0661752  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3025  secretory protein  51.55 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1318  secretory protein  43.36 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.011576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  36.17 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  41.84 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1121  hypothetical protein  62.86 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  44.12 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  43.66 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  43.66 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.88 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.88 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3024  secretory protein  58.62 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  25.64 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  45.59 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  65 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  48.33 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  47.27 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  47.27 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  44.83 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  65.85 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  65.85 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  41.94 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  38.46 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  52.08 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.71 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  42.65 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.25 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.37 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  34.75 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  41.18 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  30 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  62.16 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  29.23 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.22 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  45.45 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  48.78 
 
 		 195 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.39 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.69 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.84 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1344  hypothetical protein  59.42 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  36 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  37.16 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  51.06 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  52.38 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  52.08 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.35 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  45.28 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  45.28 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  45.28 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  34.65 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  64.1 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.14 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  64.1 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  64.1 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  64.1 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  36.92 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  32.84 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  55 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  64.1 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  55.26 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.37 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  39.42 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  41.94 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.13 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  48.08 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  43.33 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  61.54 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  41.94 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  39.29 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  61.54 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.78 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  53.49 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  61.54 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  53.49 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  45.45 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  41.49 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  43.4 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.85 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.18 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  43.64 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.42 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  44.23 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>