More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1318 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1318  secretory protein  100 
 
 
149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.011576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  68 
 
 
149 aa  205  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1825  secretory protein  43.36 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0661752  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  52.94 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3025  secretory protein  45.31 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1121  hypothetical protein  43.64 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  51.72 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  39.73 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  39.73 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  57.78 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  50 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  35.04 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  46.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  29.94 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  46.43 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.98 
 
 
176 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.98 
 
 
176 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  36.71 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  34.69 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.17 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  28.97 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  34.69 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  43.4 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  59.46 
 
 
188 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  48.98 
 
 
187 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  30.67 
 
 
182 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  45.28 
 
 
187 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39.66 
 
 
142 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  30.86 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  41.1 
 
 
186 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  31.73 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  41.1 
 
 
186 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  45.61 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  55.26 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  29.08 
 
 
211 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.66 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  52.38 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  48 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.22 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  47.06 
 
 
218 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  44.83 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  41.1 
 
 
208 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 
171 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.25 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  47.17 
 
 
527 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  40 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.5 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  43.4 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
169 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  43.4 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  43.4 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  75 
 
 
168 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  32.41 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  43.1 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  31.1 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  31.53 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  59.46 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  36.47 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  30.36 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  60 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  47.17 
 
 
634 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.83 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  36.25 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  31.1 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.77 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.33 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  35.48 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  38.16 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  37.5 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.74 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  51.22 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  47.83 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  45 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  50 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  50 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  59.09 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  41.82 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  36.25 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  48.15 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  40.3 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  34.74 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  40 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  52.63 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  48 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  33.8 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  36.25 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>