140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1319 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  100 
 
 
149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1318  secretory protein  68 
 
 
149 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.011576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  41.67 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  41.18 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1825  secretory protein  35.17 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0661752  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  43.08 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  32.84 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  35.29 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3025  secretory protein  38.28 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1121  hypothetical protein  37.38 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  30.82 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  26.85 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  33.85 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  34.33 
 
 
121 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  30.61 
 
 
548 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  36.67 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  31.17 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  50 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  31.34 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  29.6 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  35 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  41.82 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  31.19 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  36.36 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  36.76 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  26.5 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.38 
 
 
193 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  35.82 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  26.53 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  36.36 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  30.77 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  33.72 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  29 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  26.17 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  26.17 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  26.17 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.43 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  54.05 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  25.23 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.67 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  25.23 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  30.84 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  55.17 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  47.37 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  32.98 
 
 
120 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  30.21 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  47.37 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  32.61 
 
 
567 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  47.37 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  47.37 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  25.23 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.67 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  40.43 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  31.25 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  36.05 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  51.28 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  32.61 
 
 
527 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  33 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  36.19 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  51.28 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.29 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  54.84 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.46 
 
 
157 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
162 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.5 
 
 
158 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.08 
 
 
175 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.36 
 
 
168 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  34.78 
 
 
148 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  52.94 
 
 
136 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0721  hypothetical protein  44.19 
 
 
70 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.873488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  31.52 
 
 
634 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  62.07 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  33.68 
 
 
169 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  41.67 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  27.2 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  51.43 
 
 
182 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  25.88 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  48.65 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  35.48 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.33 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  50 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  45.45 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  33.68 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  62.07 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  62.07 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  31.11 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  40.35 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  35 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>