More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3024 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3024  secretory protein  100 
 
 		 160 aa  320  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3025  secretory protein  67.19 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  46.97 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  41.54 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  41.54 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1825  secretory protein  57.63 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0661752  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  41.54 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  35.65 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  40.98 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  40.98 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  42.37 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  44.44 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  40.85 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  42.37 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  34.72 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  42.37 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  35.48 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  38.18 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  32.29 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  45.45 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  30.77 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  37.1 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  37.1 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  37.5 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  41.82 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  41.82 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  42.62 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  37.7 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  35.71 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  37.7 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.38 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.82 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  55.26 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.83 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  34.92 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  32.89 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  44.19 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  36.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  38.89 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0721  hypothetical protein  52.38 
 
 		 70 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.873488 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  36.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  38.46 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  51.11 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  42.86 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  39.29 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  35.09 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.04 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  45.1 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  42.86 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  32.88 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  32.88 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  37.04 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>