180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  49.5 
 
 		 716 aa  664    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  100 
 
 		 706 aa  1476    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  47.86 
 
 		 726 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  48.57 
 
 		 721 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  46.21 
 
 		 713 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.39 
 
 		 695 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  48.07 
 
 		 718 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  54.24 
 
 		 695 aa  769    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  52.66 
 
 		 695 aa  747    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  46.48 
 
 		 725 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.3 
 
 		 722 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  54.43 
 
 		 697 aa  792    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.28 
 
 		 705 aa  758    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  55.72 
 
 		 701 aa  786    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  53.43 
 
 		 697 aa  769    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 734 aa  692    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.48 
 
 		 702 aa  638    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  47.58 
 
 		 727 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 711 aa  679    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  47.3 
 
 		 703 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  59.22 
 
 		 697 aa  852    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  72.52 
 
 		 696 aa  1057    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  49.5 
 
 		 717 aa  652    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  54.08 
 
 		 695 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  52.66 
 
 		 697 aa  751    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  47.78 
 
 		 723 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  68.75 
 
 		 697 aa  987    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  52.93 
 
 		 702 aa  753    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  55.03 
 
 		 699 aa  771    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  54.6 
 
 		 695 aa  788    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  47.42 
 
 		 726 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  47.02 
 
 		 726 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.77 
 
 		 723 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  46.57 
 
 		 714 aa  635  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  46.59 
 
 		 712 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  46.73 
 
 		 714 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  45.4 
 
 		 728 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  47.86 
 
 		 730 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  47.7 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  47.15 
 
 		 725 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.45 
 
 		 727 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  46.16 
 
 		 714 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.39 
 
 		 729 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  46.4 
 
 		 723 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  46.71 
 
 		 721 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 		 728 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.13 
 
 		 724 aa  609  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  42.72 
 
 		 732 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  44.46 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.68 
 
 		 727 aa  610  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  46.58 
 
 		 733 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  44.29 
 
 		 723 aa  593  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  44.98 
 
 		 722 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  45.78 
 
 		 730 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  43.95 
 
 		 729 aa  557  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  42.82 
 
 		 724 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  42.84 
 
 		 724 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.44 
 
 		 676 aa  536  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  41.44 
 
 		 699 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.59 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.04 
 
 		 688 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.43 
 
 		 716 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.54 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.53 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  29.83 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  25.41 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  26.19 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  26.23 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  25.79 
 
 		 476 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  30 
 
 		 447 aa  56.2  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  31.08 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.71 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 		 439 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32.67 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  29.66 
 
 		 433 aa  54.7  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  37.5 
 
 		 476 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  31.08 
 
 		 448 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  38.75 
 
 		 473 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  38.27 
 
 		 446 aa  53.9  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  34.52 
 
 		 444 aa  54.3  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  24.6 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  26.35 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  36.59 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.56 
 
 		 445 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 443 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  34.52 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  36.59 
 
 		 444 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.05 
 
 		 444 aa  51.6  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  23.91 
 
 		 447 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  25.15 
 
 		 442 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  29.85 
 
 		 430 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>