More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1977 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1977  histidine kinase  100 
 
 		 534 aa  1066    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.313704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  48.14 
 
 		 698 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.89 
 
 		 627 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.34 
 
 		 592 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 815 aa  293  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 674 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 969 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 973 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 		 873 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  36.29 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 579 aa  277  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 1691 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 1120 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 995 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 		 765 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 772 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 902 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  41.07 
 
 		 578 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 882 aa  269  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1433 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 907 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 647 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 		 645 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 717 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 764 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 604 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 874 aa  266  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 1362 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 724 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 597 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 		 859 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 791 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1177 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  35.42 
 
 		 786 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 741 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  39.48 
 
 		 1014 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  39.48 
 
 		 988 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  39.48 
 
 		 1032 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 803 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 898 aa  263  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.35 
 
 		 1193 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  40.87 
 
 		 661 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 		 957 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.17 
 
 		 882 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 881 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 940 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 1199 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 864 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.62 
 
 		 738 aa  260  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1070 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 916 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 895 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  40 
 
 		 826 aa  260  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  37.96 
 
 		 943 aa  259  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 718 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 835 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.05 
 
 		 968 aa  259  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1075 aa  259  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  42.42 
 
 		 1125 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 781 aa  259  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1195 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  39.22 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  39.89 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 850 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 		 1005 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 1125 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1121 aa  258  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 876 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 780 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 877 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0221  histidine kinase  41.78 
 
 		 476 aa  257  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 		 865 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 738 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  35.6 
 
 		 827 aa  256  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 645 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 631 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 		 695 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  35.08 
 
 		 539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1068 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 570 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 785 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 863 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1055 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 896 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  36.5 
 
 		 732 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 704 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 911 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 968 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1169 aa  252  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  39.59 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 781 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 778 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 817 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 962 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1350 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  37.5 
 
 		 952 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1127 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  39.38 
 
 		 984 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>