201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1093 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  100 
 
 
434 aa  890    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  60.19 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  55.69 
 
 
416 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  48.97 
 
 
416 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  43.86 
 
 
411 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  48.32 
 
 
425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  42.75 
 
 
423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  39.52 
 
 
408 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  42.36 
 
 
449 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  45.3 
 
 
416 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  43.5 
 
 
411 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  43.84 
 
 
416 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  43.56 
 
 
416 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  43.19 
 
 
429 aa  289  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  44.73 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  44.73 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  43.84 
 
 
416 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  42.23 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  43.56 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  43.73 
 
 
412 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  41.1 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  41.39 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  40.05 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  42.09 
 
 
408 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  41.32 
 
 
429 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  36.25 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  40.56 
 
 
412 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  39.94 
 
 
425 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  39.27 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  40.66 
 
 
416 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  36.99 
 
 
405 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  36.15 
 
 
425 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  33.24 
 
 
436 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  35.86 
 
 
422 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  35.76 
 
 
413 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  38.22 
 
 
418 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  33.56 
 
 
432 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  36.87 
 
 
418 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  34.56 
 
 
413 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  36.83 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  37.36 
 
 
418 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  34.23 
 
 
413 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  33.89 
 
 
432 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  33.89 
 
 
413 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  33.89 
 
 
413 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  34.33 
 
 
432 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  32.54 
 
 
413 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  33.22 
 
 
413 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  32.49 
 
 
410 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  32.89 
 
 
413 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
420 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  32.05 
 
 
420 aa  160  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  36.71 
 
 
413 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.29 
 
 
465 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  29.12 
 
 
436 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
398 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
398 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
428 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
435 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  36.51 
 
 
448 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  31.54 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  34.31 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
513 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  28.83 
 
 
390 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
464 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.72 
 
 
379 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.76 
 
 
379 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  28.62 
 
 
434 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  28.23 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.5 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25.9 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.8 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  29.17 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.16 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.01 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  24.12 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  26.46 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  25.78 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.55 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  22.66 
 
 
379 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
337 aa  63.5  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  24.72 
 
 
374 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  25.18 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  25.18 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
392 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  23.31 
 
 
382 aa  60.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.19 
 
 
380 aa  60.5  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.08 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  23.73 
 
 
428 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  25 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  25.15 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  28.4 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  23.75 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>