252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6009 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 190 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  62.14 
 
 		 159 aa  157  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  58.57 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 162 aa  141  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  35.17 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.46 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  35.56 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 147 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  30.09 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  35.94 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.93 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 128 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 138 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.57 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  40 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.09 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  35.9 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.19 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1243  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0356088  normal  0.548993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>