More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3335 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  48.97 
 
 
294 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.72 
 
 
290 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
297 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  45.3 
 
 
294 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
299 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
284 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
297 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
293 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
293 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  44.29 
 
 
302 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 
300 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  40.06 
 
 
330 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  47.21 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
288 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
284 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
284 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
298 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  42.01 
 
 
312 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
312 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 
293 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
293 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  42.2 
 
 
316 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
314 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
293 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
283 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
283 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
280 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
280 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
279 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.5 
 
 
278 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
279 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
275 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  35.36 
 
 
280 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.74 
 
 
280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
279 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
279 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
280 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  35.98 
 
 
279 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
574 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  34.62 
 
 
279 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  33.21 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
280 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  30.94 
 
 
295 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
279 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
279 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
272 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  32.61 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  33.72 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.62 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  30.74 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  30.74 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
554 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
274 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.33 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716489  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  33.81 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
551 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 
700 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0015448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
273 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  31.87 
 
 
271 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.758022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
550 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0324  spermidine/putrescine transport system permease protein  27.51 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000555031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>