145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2525 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 179 aa  345  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  51.85 
 
 		 114 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  51.25 
 
 		 109 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  45.12 
 
 		 112 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  45.12 
 
 		 112 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  43.3 
 
 		 112 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  46.99 
 
 		 113 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  45.78 
 
 		 113 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  48.15 
 
 		 114 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  44.94 
 
 		 113 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  46.84 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  44.59 
 
 		 444 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  41.98 
 
 		 97 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  43.42 
 
 		 623 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  46.25 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  46.84 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  45 
 
 		 417 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  45.83 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  43.21 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  40.96 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  42.11 
 
 		 358 aa  72  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  44.16 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  41.25 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  41.24 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  41.67 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  38.78 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  36.65 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.51 
 
 		 749 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  38.89 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  38.75 
 
 		 116 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  41.77 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  39.29 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  47.42 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  41.57 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  44.44 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  42.5 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  37.04 
 
 		 116 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  40.26 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  45.71 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  38.96 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  43.56 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  38.27 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  40.48 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  37.78 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  39.8 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  47.37 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  32.41 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  37.62 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  34.41 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  36.79 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  35.23 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3225  cell surface lipoprotein  36.25 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00779237  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  45.83 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  38.27 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  34.78 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  27.48 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.36 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  34.75 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  35.62 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.38 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  31.11 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.38 
 
 		 100 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.38 
 
 		 99 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  29.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  29.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  29.11 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  29.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  32.69 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  36.71 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  31.51 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  34.21 
 
 		 454 aa  52.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  37.18 
 
 		 456 aa  52  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  40.96 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  32.88 
 
 		 458 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  32.38 
 
 		 276 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.83 
 
 		 111 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  44.12 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  41.43 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  31.53 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  33.67 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  40.58 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  32.61 
 
 		 107 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  32.31 
 
 		 138 aa  48.5  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  28.21 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  29.7 
 
 		 123 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  43.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  43.48 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  29.27 
 
 		 103 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  36.49 
 
 		 771 aa  48.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  31.82 
 
 		 119 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>