More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2247 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 328 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  64.33 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  64.82 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  61.59 
 
 		 317 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  59.93 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 		 321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  60.14 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  56.01 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  60.26 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  57.68 
 
 		 341 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  53.98 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  55.21 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  54.04 
 
 		 304 aa  302  7.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  55.02 
 
 		 307 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  56.29 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  56.48 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  56.86 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  52.24 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  54.14 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  56.06 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  51.41 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  50.31 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  54.74 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  53.63 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  53.33 
 
 		 313 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  54.18 
 
 		 306 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  51.36 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  54.06 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  51.28 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  45.33 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 		 323 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.15 
 
 		 317 aa  238  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.99 
 
 		 535 aa  225  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  45.17 
 
 		 534 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.19 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  50.69 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  43.13 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 		 316 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.29 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  43.11 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  45.08 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.54 
 
 		 622 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  46.5 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  42.68 
 
 		 624 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  46.69 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  46.24 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  44.09 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  45.96 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  44.28 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  45.89 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  39 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.31 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  38.43 
 
 		 295 aa  186  7e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  43.95 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  41.18 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  39.2 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  40.6 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  39.88 
 
 		 472 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  46.22 
 
 		 276 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  42.22 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  39.24 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>