More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1710 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  100 
 
 		 463 aa  928    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  36.5 
 
 		 440 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  35.44 
 
 		 461 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  31.55 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  31.94 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  32.26 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.14 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  32.68 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  33.93 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.97 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  32.25 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.19 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  30.15 
 
 		 462 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.18 
 
 		 567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.59 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.55 
 
 		 551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  33.11 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 559 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.84 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.32 
 
 		 675 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.59 
 
 		 524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  31.11 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.69 
 
 		 529 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  29.26 
 
 		 530 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.69 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.55 
 
 		 1032 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.72 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.72 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  33.93 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.03 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.98 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  29.61 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 490 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.53 
 
 		 480 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.14 
 
 		 533 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 463 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.93 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.55 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.38 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.68 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.25 
 
 		 578 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.03 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.52 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.56 
 
 		 601 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.81 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  31.37 
 
 		 417 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.93 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.25 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.68 
 
 		 530 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.2 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  32.31 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.78 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  28.16 
 
 		 694 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  32.78 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 691 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 691 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.08 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.37 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  26.25 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.2 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.5 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.11 
 
 		 603 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  32.43 
 
 		 475 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 691 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.46 
 
 		 330 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 691 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.9 
 
 		 1055 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 691 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.5 
 
 		 526 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  30 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.94 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.71 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.34 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.34 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.03 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.51 
 
 		 544 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.75 
 
 		 508 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.07 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.4 
 
 		 566 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  32.89 
 
 		 361 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.34 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.09 
 
 		 694 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.78 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.3 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.9 
 
 		 560 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.45 
 
 		 446 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.59 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.79 
 
 		 611 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  32.21 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.27 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.36 
 
 		 669 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  27.81 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.05 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  31.99 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.05 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.92 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>