185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0396 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 141 aa  259  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  38.35 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  38.35 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  37.59 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  39.69 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  38.64 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  42.45 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  42.45 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  41.27 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  40.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  37.59 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  42.75 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  41.73 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  41.82 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  39.34 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  35.66 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  38.21 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  45.63 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  39.42 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  38.35 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  41.59 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  41.38 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  38.52 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  39.85 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  41.88 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  43.27 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  37.4 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  37.4 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  36.36 
 
 		 333 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  36.29 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.34 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.71 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  39.42 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  38.89 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  41.98 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  41.98 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  37.78 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  37.7 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  29.6 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.68 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  33.58 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.88 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  34.11 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  36.04 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  34.81 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  41.07 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  33.82 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  35.07 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  32.46 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  30.95 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  48.39 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  29.25 
 
 		 335 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  35.94 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.72 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  35.07 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.59 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  34.56 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  32.43 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.7 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  34.82 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  38.76 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.81 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  34.96 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  34.33 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  36 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  34.33 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  32.12 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  34.82 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  35.2 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  33.82 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  35.92 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  35.04 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>