More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1014 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 372 aa  756    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.42 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.14 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  43.14 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.7 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  42.86 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.82 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 349 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.38 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  41.99 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  48.6 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  46.08 
 
 		 342 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  47.67 
 
 		 353 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  52.02 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  42.3 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  44.03 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  51.03 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  52.7 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  52.25 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  52.7 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.21 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  48.16 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  46.67 
 
 		 355 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  52.25 
 
 		 257 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  38.24 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.8 
 
 		 257 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  50.9 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  46.34 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.75 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 387 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  47.39 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  47.08 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  47.08 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.4 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  48.13 
 
 		 257 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  45.77 
 
 		 405 aa  232  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  47.93 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.11 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  48.63 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  45.74 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  41.69 
 
 		 342 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  39.66 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  43.73 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  47.76 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  45.75 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  43.73 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.47 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.64 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  45.68 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  46.61 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  45.31 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  43.51 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  44.76 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  45.42 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  40.68 
 
 		 355 aa  222  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  44.94 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 1057 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2834  ABC transporter related  43.62 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.698538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  46.27 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  44.96 
 
 		 361 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  38.24 
 
 		 363 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  39.58 
 
 		 346 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 361 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  41.83 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.77 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.63 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  39.15 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  37.54 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  46.41 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  42.59 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  38.59 
 
 		 345 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  39.43 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  34.44 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.43 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 390 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  42.38 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.56 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  44.44 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.11 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.11 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.11 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.11 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>