75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0555 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  95.15 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 		 241 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  42.36 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  31.8 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  30.88 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  32.83 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  35.05 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  31.65 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  30.28 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.39 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  25.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  24.55 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  26.63 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  23.4 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  24.48 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  26.28 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.82 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  24.73 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  31.48 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  23.87 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  24.66 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  25.31 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  25.16 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  24.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  22.09 
 
 		 240 aa  44.7  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  24.34 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  25.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  21.37 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  24.83 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  29.63 
 
 		 170 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 182 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 172 aa  42  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  24.31 
 
 		 186 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 182 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  23.48 
 
 		 213 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  26.45 
 
 		 239 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  23.65 
 
 		 206 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 239 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  23.87 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  24.68 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>