72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0569 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  100 
 
 		 206 aa  416  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  95.15 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1178  isochorismatase hydrolase  44.93 
 
 		 241 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000195875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1765  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0144  nicotinamidase-like amidase  32.26 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0388  nicotinamidase-like amidase  31.34 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4288  nicotinamidase-like amidase  32.83 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0227  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.448166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  35.16 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0395  hypothetical protein  35.68 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0502  cytoplasmic membrane protein  32.57 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1062  cytoplasmic membrane protein  30.88 
 
 		 242 aa  94.7  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1739  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0101718 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.59 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.59 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2452  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  23.4 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  26.28 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3726  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.76 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  26.63 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  25.86 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3779  isochorismatase hydrolase  24.09 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  24.48 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.82 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  24.84 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  24.66 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  30.86 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  24.54 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  25.31 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  24.59 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  23.46 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  25.87 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  23.87 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  28.68 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  24.18 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  24.83 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.45 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  27.33 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  25.66 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  23.87 
 
 		 215 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 180 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  24.53 
 
 		 234 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  23.48 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  21.37 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  23.31 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>