More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0442 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0442  putative iron ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  60.66 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.12 
 
 		 259 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  47.8 
 
 		 342 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  48.56 
 
 		 378 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 387 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.05 
 
 		 355 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  43.66 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  44.95 
 
 		 257 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  47.3 
 
 		 360 aa  214  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  44.5 
 
 		 257 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  44.5 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 354 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  48.98 
 
 		 377 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.34 
 
 		 367 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.84 
 
 		 366 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  45.58 
 
 		 365 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  44.65 
 
 		 358 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 		 257 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  44.65 
 
 		 358 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  44.95 
 
 		 257 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  44.95 
 
 		 257 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  43.69 
 
 		 370 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  48.36 
 
 		 359 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  49.75 
 
 		 369 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.65 
 
 		 386 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 353 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  44.5 
 
 		 257 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 353 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  46.63 
 
 		 349 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  50 
 
 		 389 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  46.05 
 
 		 369 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.12 
 
 		 358 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  46.15 
 
 		 349 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  45.85 
 
 		 364 aa  207  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.08 
 
 		 390 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  42.92 
 
 		 359 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  45.89 
 
 		 357 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  45.58 
 
 		 410 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  46.15 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  44.14 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  45.67 
 
 		 349 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1344  ABC transporter related  46.73 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.274567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.2 
 
 		 346 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.91 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2991  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.31 
 
 		 362 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  46.83 
 
 		 373 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  45.77 
 
 		 363 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  44.78 
 
 		 365 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 343 aa  205  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  46.27 
 
 		 355 aa  204  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 346 aa  204  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 352 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 341 aa  204  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.71 
 
 		 342 aa  204  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6023  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  50 
 
 		 353 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  50 
 
 		 353 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  47.21 
 
 		 357 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  43.69 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  47.14 
 
 		 374 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.58 
 
 		 256 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  45.09 
 
 		 346 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  45.09 
 
 		 346 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  45.09 
 
 		 346 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  44.44 
 
 		 352 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 		 349 aa  201  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  45.12 
 
 		 369 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  45.05 
 
 		 342 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  44.19 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  47.8 
 
 		 353 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  48.22 
 
 		 369 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  46.34 
 
 		 391 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  46.6 
 
 		 342 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  45.89 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  43.72 
 
 		 361 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  46.05 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  45.19 
 
 		 349 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.26 
 
 		 361 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.74 
 
 		 343 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  46.34 
 
 		 352 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 		 342 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  42.44 
 
 		 357 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 		 356 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.27 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  46.53 
 
 		 349 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>