More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2785 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2785  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0012  response regulator receiver protein  69.42 
 
 
125 aa  174  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7205  normal  0.156633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3276  response regulator receiver protein  63.93 
 
 
126 aa  169  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  41.18 
 
 
627 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
932 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1101 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
846 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1068 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.29 
 
 
571 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
846 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  40.8 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
589 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1044 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.98 
 
 
666 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1596 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  37.19 
 
 
755 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  39.2 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  35.04 
 
 
786 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
717 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
868 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
816 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
530 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
907 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.09 
 
 
763 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1362 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1070 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
847 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  34.26 
 
 
710 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  31.93 
 
 
1060 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
801 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3343  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
800 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.339102  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.89 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1005 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  32.52 
 
 
559 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.14 
 
 
796 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
873 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.89 
 
 
240 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  36.67 
 
 
736 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  32.23 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
973 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
827 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  35.34 
 
 
606 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
962 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1162 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
902 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
984 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
678 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  36.28 
 
 
399 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
887 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
946 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 
1331 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1340 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  37.9 
 
 
1070 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1236 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1611 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07945  Histidine kinase G2 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ26]  33.33 
 
 
659 aa  79.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  31.09 
 
 
681 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  32.5 
 
 
1200 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
705 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1005 aa  79.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  33.88 
 
 
699 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1009 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  30.25 
 
 
681 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  34.51 
 
 
762 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1397 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
869 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1310  histidine kinase  32 
 
 
927 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28038  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.29 
 
 
772 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.76 
 
 
1885 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  31.97 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1078 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
957 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
765 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  34.19 
 
 
544 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
859 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
873 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
1791 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  37.07 
 
 
733 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  37.29 
 
 
783 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1234 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
928 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
650 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1324 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
788 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
667 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0533  histidine kinase  34.58 
 
 
244 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  31.97 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
778 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
860 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
2022 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
964 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
1230 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
918 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1172 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>