More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2653 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  51.92 
 
 		 287 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  49.32 
 
 		 295 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  38.11 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  39.44 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  37.63 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  35.92 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  35.92 
 
 		 287 aa  205  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  36.65 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  34.71 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.8 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  33.1 
 
 		 296 aa  186  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.17 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34.87 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.6 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  32.74 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  33.67 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  34.75 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  37.08 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.66 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  33.19 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.47 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.77 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  32.63 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  28.67 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.36 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  30.82 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.07 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.28 
 
 		 314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  29.13 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.38 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  26.9 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  28.51 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  26.95 
 
 		 350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  23.91 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  25.46 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  31.56 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.22 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.33 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.33 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  23.88 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.96 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.75 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  26.84 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  24.82 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.31 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  24.91 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  24.45 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  25.64 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  23.26 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.31 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.31 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  23.65 
 
 		 328 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.52 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.95 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.1 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  25.33 
 
 		 418 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.1 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.02 
 
 		 443 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  25.46 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.87 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  25.99 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  31.86 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  24.74 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  24.74 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  24.74 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.76 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  25.68 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.98 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 429 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  25.64 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.37 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27.38 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  26.43 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  26.67 
 
 		 443 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  26.23 
 
 		 444 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.82 
 
 		 444 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  28.63 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  26.67 
 
 		 443 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  27.69 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  28.91 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  26.69 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  30.83 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  28.91 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  31.03 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>