More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2298 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.98 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  28.49 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  23.48 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  22.41 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  22.06 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  22.67 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  22.44 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  26.92 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  20 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.5 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  22.98 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.36 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.36 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.36 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.36 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.36 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  20.94 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  20.94 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  20.94 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  20.94 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  20.94 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  21.88 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  21.88 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  20.65 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  20.81 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.36 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  23.58 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  21.18 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  21.75 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  20.52 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.2 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  21.51 
 
 		 662 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  22.63 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  19.29 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.69 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  21.01 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.75 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  21.34 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  24.78 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  23.93 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.25 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  21.03 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  21.1 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  22.05 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.37 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  24.23 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.02 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  24.23 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  24.07 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  23.43 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  23.43 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  23.43 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  23.49 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  23.91 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  18.94 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  22.68 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  24.25 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  22.61 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  19.6 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  19.6 
 
 		 679 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  23.44 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  23.06 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  22.15 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  23.58 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  22.26 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.12 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  20.81 
 
 		 650 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  22.02 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  22.36 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  20 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  23.92 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  22.94 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.48 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  24.06 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  22.58 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  22.63 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  22.63 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  22.42 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  22.63 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  20.82 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  21.73 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  22.63 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  21.05 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  22.63 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.1 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  22.63 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  22.83 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  22.5 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  20.97 
 
 		 801 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>