101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1404 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  100 
 
 
169 aa  349  8.999999999999999e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  48.32 
 
 
521 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  44.31 
 
 
849 aa  157  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  45.03 
 
 
535 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  48.3 
 
 
534 aa  153  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  48.3 
 
 
534 aa  152  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  43.2 
 
 
541 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  44.05 
 
 
535 aa  151  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  41.07 
 
 
229 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  34.44 
 
 
529 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  38.36 
 
 
498 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  36.09 
 
 
543 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  40.41 
 
 
537 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  40.41 
 
 
537 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  36.54 
 
 
503 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  35.33 
 
 
564 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  39.57 
 
 
530 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  36.36 
 
 
590 aa  111  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  36.36 
 
 
590 aa  111  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  36.36 
 
 
590 aa  111  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  36.08 
 
 
566 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.14 
 
 
557 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  32.74 
 
 
563 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  32.94 
 
 
586 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  35.97 
 
 
535 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  34.78 
 
 
550 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  30.87 
 
 
565 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  37.41 
 
 
535 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  35.71 
 
 
561 aa  97.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  35.03 
 
 
528 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  30.67 
 
 
569 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  28.9 
 
 
580 aa  94.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  30.67 
 
 
561 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.59 
 
 
491 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  32.57 
 
 
602 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  34.9 
 
 
553 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  29.38 
 
 
564 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  33.33 
 
 
577 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  32.74 
 
 
577 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  32.74 
 
 
455 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  29.86 
 
 
581 aa  89  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  34.01 
 
 
542 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.33 
 
 
552 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  33.78 
 
 
542 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  32.68 
 
 
565 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  31.45 
 
 
581 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  31.97 
 
 
545 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  31.97 
 
 
585 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  29.3 
 
 
581 aa  85.1  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  29.94 
 
 
558 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  32.24 
 
 
574 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  27.39 
 
 
581 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  29.68 
 
 
574 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  30.57 
 
 
583 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  31.85 
 
 
561 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  30 
 
 
546 aa  82.4  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  30.3 
 
 
556 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  34.81 
 
 
573 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  30.41 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  32.48 
 
 
562 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  32.48 
 
 
562 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  29.94 
 
 
356 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  30.32 
 
 
562 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.32 
 
 
562 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.32 
 
 
562 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.78 
 
 
555 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  30.71 
 
 
540 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  29.29 
 
 
540 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.26 
 
 
602 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  30.14 
 
 
568 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  28.57 
 
 
593 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  28.57 
 
 
565 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  28.12 
 
 
629 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  29.1 
 
 
563 aa  67.8  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  29.1 
 
 
563 aa  67.8  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  28.77 
 
 
569 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  22.4 
 
 
588 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  28.76 
 
 
579 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  28.74 
 
 
606 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  28.74 
 
 
606 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  25.57 
 
 
581 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  29.32 
 
 
584 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  24.71 
 
 
604 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.42 
 
 
611 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  28.48 
 
 
570 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.13 
 
 
590 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.13 
 
 
562 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  28.46 
 
 
581 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.13 
 
 
591 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  27.82 
 
 
553 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  27.82 
 
 
553 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  24.7 
 
 
571 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  23.38 
 
 
546 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  20.39 
 
 
572 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  32 
 
 
489 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  25 
 
 
629 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  26.79 
 
 
489 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  25.18 
 
 
551 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  23.93 
 
 
489 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  23.93 
 
 
489 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>