More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0202 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0116  transketolase  64.75 
 
 		 634 aa  870    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  62.72 
 
 		 632 aa  830    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  61.08 
 
 		 656 aa  824    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  62.88 
 
 		 632 aa  833    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  62.88 
 
 		 632 aa  833    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  68.87 
 
 		 636 aa  944    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  59.17 
 
 		 639 aa  782    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  100 
 
 		 636 aa  1308    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  68.55 
 
 		 636 aa  939    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  70.44 
 
 		 633 aa  954    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  45.55 
 
 		 654 aa  568  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.49 
 
 		 662 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  44.26 
 
 		 667 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  44.9 
 
 		 668 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  44.63 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.63 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  44.97 
 
 		 668 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  44.29 
 
 		 666 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  44.9 
 
 		 697 aa  546  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  43.72 
 
 		 666 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  43.87 
 
 		 666 aa  548  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  43.57 
 
 		 666 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  43.87 
 
 		 666 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  43.72 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  43.72 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  44.07 
 
 		 668 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  43.87 
 
 		 666 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  43.57 
 
 		 680 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  43.72 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  44.24 
 
 		 671 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  43.27 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  43.84 
 
 		 666 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.5 
 
 		 665 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  43.62 
 
 		 668 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  43.1 
 
 		 684 aa  535  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  43.57 
 
 		 666 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  43.48 
 
 		 666 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  41.8 
 
 		 688 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  42.68 
 
 		 664 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  40.86 
 
 		 699 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  42.79 
 
 		 665 aa  526  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  44.14 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  42.49 
 
 		 665 aa  525  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  43.66 
 
 		 681 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  42.02 
 
 		 653 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  42.3 
 
 		 666 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  43.33 
 
 		 666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  42.99 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  43.48 
 
 		 663 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  42.21 
 
 		 672 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  42.4 
 
 		 676 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  42.34 
 
 		 665 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  43.19 
 
 		 687 aa  514  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  43.79 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  42.4 
 
 		 676 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  41.95 
 
 		 671 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  44.19 
 
 		 667 aa  515  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  44.14 
 
 		 662 aa  513  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  44.83 
 
 		 668 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  42.71 
 
 		 664 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  43.03 
 
 		 723 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  42.71 
 
 		 664 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  42.22 
 
 		 675 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  42.71 
 
 		 664 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  42.15 
 
 		 673 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  42.26 
 
 		 664 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  42.1 
 
 		 674 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  40.98 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  41.02 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  43.03 
 
 		 665 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  40.98 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  40.3 
 
 		 692 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  43.01 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  43.01 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  41.05 
 
 		 668 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  42.71 
 
 		 678 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  43.01 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  43.01 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  41.93 
 
 		 664 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  42.19 
 
 		 665 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  40.67 
 
 		 712 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  40.91 
 
 		 671 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  43.01 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  40.65 
 
 		 681 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  43.01 
 
 		 667 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  43.01 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  39.43 
 
 		 741 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  42.11 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  42.11 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  42.11 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  42.18 
 
 		 679 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  42.86 
 
 		 667 aa  505  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  40.32 
 
 		 697 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  43.18 
 
 		 665 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  42.11 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  41.16 
 
 		 657 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  42.11 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  40.78 
 
 		 680 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  39.65 
 
 		 741 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  39.79 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>