More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0528 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  100 
 
 		 376 aa  723    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  51.08 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  51.31 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  50 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  34.54 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  32.45 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  32.19 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  29.27 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  24.93 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  22.3 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  26.82 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.36 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  25.52 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  20.96 
 
 		 429 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.58 
 
 		 434 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  27.19 
 
 		 426 aa  95.9  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.61 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  23.89 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  22.2 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.13 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.19 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  21.67 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  21.71 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.13 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 852 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.84 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.24 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  21.81 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.44 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.45 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  24.66 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.53 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.52 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.06 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.77 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.44 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  21.34 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  19.53 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.62 
 
 		 847 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.65 
 
 		 845 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  22.79 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.64 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  20.39 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.37 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.69 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  21.32 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  23.19 
 
 		 850 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  22.79 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.86 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.78 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  24.41 
 
 		 858 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.78 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.47 
 
 		 857 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.19 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  23.44 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.46 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  24.73 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  24.27 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  27.66 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.54 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  23.51 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 848 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.54 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  22.25 
 
 		 656 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.71 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  30.07 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  21.49 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1175  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.63 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  21.5 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  22.73 
 
 		 827 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  21.2 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.63 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.53 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.16 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.63 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1620  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.11 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.84 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>