134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0620 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  100 
 
 
390 aa  804    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  32.65 
 
 
415 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  31.92 
 
 
414 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  31.49 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  33 
 
 
415 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  30.6 
 
 
415 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  30.65 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  33.74 
 
 
423 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  31.66 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  32.89 
 
 
414 aa  169  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  32.63 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  34.8 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  32.84 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  35.18 
 
 
405 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  32.84 
 
 
433 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  31.21 
 
 
434 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  27.09 
 
 
418 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  29.02 
 
 
425 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  29.15 
 
 
414 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  31.23 
 
 
412 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  31.45 
 
 
407 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  33.23 
 
 
410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  31.15 
 
 
430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  30.66 
 
 
414 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  32.91 
 
 
435 aa  145  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  31.95 
 
 
410 aa  143  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  31.56 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  31.23 
 
 
387 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  34.09 
 
 
430 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  32.9 
 
 
420 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  28.77 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  31.65 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  31.95 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  32.79 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  28.32 
 
 
387 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.5 
 
 
420 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 
420 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.19 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.03 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  30.51 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  31.16 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 
429 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  29.64 
 
 
405 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.93 
 
 
418 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  26.42 
 
 
417 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.09 
 
 
431 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.72 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  29.28 
 
 
330 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  27.38 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  34.3 
 
 
431 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.1 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  27.51 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  25.13 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.01 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  25.95 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  26.07 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.96 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  22.95 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  24.57 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  24.88 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.92 
 
 
439 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.56 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  23.67 
 
 
449 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  37.6 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  27.16 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  28.66 
 
 
152 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  26.88 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  25.38 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.63 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.24 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  27.22 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  25.23 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  25.45 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.1 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  27.38 
 
 
453 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.19 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  24.93 
 
 
403 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  27.27 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  26.75 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  29.24 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  29.24 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  29.52 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25.76 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  28.66 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  27.98 
 
 
318 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  26.16 
 
 
418 aa  59.7  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.94 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  24.85 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  23.24 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  31.32 
 
 
436 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.17 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  22.74 
 
 
434 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>