121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12303 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  996    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  57.23 
 
 		 493 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  40.89 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  40.53 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  32.77 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 491 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  22.13 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  20.16 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  21.17 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  21.63 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  19.55 
 
 		 475 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  19.55 
 
 		 475 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  19.55 
 
 		 475 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  20.72 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  21.33 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  22.02 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  19.6 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  21.73 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  20.72 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  21.4 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  20 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  21.22 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  21.53 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  20.21 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  21.54 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  20.88 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  45.9 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  23.19 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  18.52 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  22.4 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  22.32 
 
 		 524 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 260 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  20.22 
 
 		 481 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 192 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  20.82 
 
 		 483 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  22.64 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  19.96 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 74 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 252 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 199 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  22.43 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  18.48 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  28.32 
 
 		 224 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  21.84 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  19.48 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.92 
 
 		 481 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 115 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  27.16 
 
 		 187 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  26.56 
 
 		 182 aa  47.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  20.08 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  22 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  27.43 
 
 		 223 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 259 aa  47  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 192 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  18.96 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  19.92 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 171 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 207 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 197 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 182 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  34.69 
 
 		 219 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  29.52 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 227 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  20.15 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 642 aa  44.3  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 185 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 183 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>