More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12083 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 204 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  26.56 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
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NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
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NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  27.38 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
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NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  28.93 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
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NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  25.23 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  23.86 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
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NC_008228  Patl_0208  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.41994  n/a   
 
 
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