More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11888 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  577  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  32.32 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  32.27 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.15 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  37.93 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  43.51 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  40.28 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  36.91 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  39.86 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  42.97 
 
 		 298 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  32.6 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  39.84 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  41.04 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  36.91 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  36.91 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  42.19 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  39.84 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  39.06 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  33.56 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  33.33 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.81 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  32.03 
 
 		 474 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  32.81 
 
 		 478 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  30.28 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  34.51 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.63 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  31.45 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  33.63 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  38.14 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  38.78 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  29.59 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  29.59 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.84 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  38.54 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  35.78 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  37.89 
 
 		 470 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  30.47 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  31.75 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  32.8 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  33.04 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  28.4 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  34.41 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  32.8 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  29.19 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  28.4 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  28.4 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  28.4 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  34.4 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  38.95 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  33.63 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  35.09 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  35.09 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.5 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  26.94 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  37.89 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  31.11 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  29.92 
 
 		 824 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  37.89 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  31.87 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  25.31 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  38.95 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  31.19 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  37.63 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.92 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  37.89 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  34.17 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  31.73 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  38.14 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  35.09 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  36.28 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  31.71 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  33.06 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  35.09 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  33.64 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  32.74 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  35.42 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  33.33 
 
 		 442 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  35.42 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  38.14 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  39.78 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  35.42 
 
 		 507 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  38.14 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  32.14 
 
 		 590 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  29.21 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  37 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  44.32 
 
 		 633 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  32.54 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  37.63 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  33.93 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  36.36 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>