More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03585 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  791    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  56.92 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  37.43 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  40.12 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  32.07 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  30.14 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  31.75 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  29.74 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  31.54 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.73 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.71 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  31.18 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  30.23 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.29 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.73 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.46 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.69 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.08 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  28.94 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.36 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.55 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.71 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  27.14 
 
 		 371 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.72 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.35 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.19 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  29.63 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.69 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  29.9 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.62 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  27.11 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.05 
 
 		 530 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.32 
 
 		 505 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  26.22 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  28.12 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.52 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.47 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  28.93 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  27.01 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.8 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.52 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.92 
 
 		 530 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  27.48 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.87 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  26.18 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  26.69 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.74 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  26.74 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  28.47 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  25 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  25.27 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.3 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.78 
 
 		 503 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  28.09 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.47 
 
 		 455 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  27.95 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.47 
 
 		 468 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  26.74 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  26.97 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  23.83 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  23.83 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  25.09 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  25.52 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.39 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  25.69 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  24.48 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  28.16 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  26.32 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  29.03 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  24.48 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  24.91 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  24.48 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  26.21 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.96 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.37 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  25.17 
 
 		 467 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.64 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  29.26 
 
 		 494 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.39 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.37 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  24.83 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25.18 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  26.82 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  26.53 
 
 		 522 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  26.07 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  24.1 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  25.68 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.1 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.46 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.46 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  26.64 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  26.07 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.9 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  26.07 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  24 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  24.22 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.91 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  23.3 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  25.57 
 
 		 327 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>