More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0782 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  257  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  64 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  63 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  63 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0046  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6083  transcriptional regulator, AraC family  47.17 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.864918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 277 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 274 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  41.18 
 
 		 275 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  39.36 
 
 		 280 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  39.81 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  39 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 281 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 281 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 432 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 299 aa  77.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 		 297 aa  77.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 264 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 273 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 277 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 279 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 278 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  40.59 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  46 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  36.89 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  33.64 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 278 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 278 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 278 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 247 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 247 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 284 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  38.05 
 
 		 293 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  38.14 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.45 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 319 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 312 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 285 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.8 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 296 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  39.66 
 
 		 300 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 296 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 300 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  43.16 
 
 		 271 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 296 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 266 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 278 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 247 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  45.74 
 
 		 293 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 291 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 284 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 279 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 292 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 313 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 275 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  38.38 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>