191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0165 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 685 aa  1397    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  57.44 
 
 		 617 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  54.22 
 
 		 689 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  42.92 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  42.92 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  43.89 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  43.89 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  43.89 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  42.26 
 
 		 689 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  35.94 
 
 		 690 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  35.6 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  35.27 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 722 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  35.41 
 
 		 829 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  41.39 
 
 		 656 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  48.64 
 
 		 385 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  48.64 
 
 		 385 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  32.9 
 
 		 579 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  60.48 
 
 		 184 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  61.29 
 
 		 125 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  32.56 
 
 		 279 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  42.65 
 
 		 153 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8272  insertion sequence ATP-binding protein  34.75 
 
 		 169 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.89 
 
 		 485 aa  87.4  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  25.94 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.34 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.65 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.65 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.44 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.66 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  22.86 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.75 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.13 
 
 		 542 aa  73.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  21.64 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.13 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.13 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  21 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  21 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.51 
 
 		 515 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26.17 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.34 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  23.23 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.93 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.1 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.29 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.83 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  36.61 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  31.41 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.34 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  22.73 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.93 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  20.37 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  26.74 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  24.43 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  26.74 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  26.74 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  22.22 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.97 
 
 		 527 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.78 
 
 		 558 aa  60.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.8 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.45 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.97 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  23.51 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.01 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  24.72 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  21.19 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  25.83 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  23.2 
 
 		 532 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  22.65 
 
 		 541 aa  57  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  23.88 
 
 		 465 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.17 
 
 		 449 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.17 
 
 		 449 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.43 
 
 		 665 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  19.87 
 
 		 517 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  24.41 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.58 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.22 
 
 		 534 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  23.32 
 
 		 537 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  21.53 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  29.61 
 
 		 227 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.7 
 
 		 415 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  22.32 
 
 		 540 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  23.94 
 
 		 513 aa  55.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.86 
 
 		 578 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  20.82 
 
 		 445 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  25.3 
 
 		 467 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  20.92 
 
 		 537 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.83 
 
 		 534 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  23.32 
 
 		 537 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  22.81 
 
 		 534 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  22.02 
 
 		 459 aa  54.3  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  22.25 
 
 		 441 aa  53.9  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>