122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1566 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  100 
 
 		 405 aa  835    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  43.01 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  31.99 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  34.19 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  33.1 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.74 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  31.33 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  31.92 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  31.02 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  31.22 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  30.95 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.28 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.83 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  31.14 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.45 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.2 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  30.05 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  29.14 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  29.09 
 
 		 412 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30.15 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  30.17 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  28.72 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  32.7 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  31.71 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.54 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  28.07 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  29.64 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.92 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  34.31 
 
 		 435 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  37.04 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  28.89 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  33.9 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  27.7 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  30.81 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  35.81 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  30.31 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  25.7 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  31.91 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  27.44 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  27.84 
 
 		 330 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  30.53 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.21 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  28.18 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  25.46 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.63 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.33 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  29.6 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.09 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  32.86 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  31.11 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.43 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  29.6 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.96 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.95 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.39 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  23.98 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.02 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  25.57 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.21 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.66 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.55 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  24.53 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  25.85 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.2 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  26.56 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  24.79 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  22.75 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  28.86 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  23.73 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  25 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  28.11 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  27.01 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.32 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  23.71 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.17 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  26.67 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.6 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.6 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  24.65 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  23.03 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.47 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  24.19 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  24.19 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  25.87 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  25 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  24.19 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.23 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  23.41 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  23.53 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  26.42 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  24.88 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  24.17 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  27.48 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>