129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1200 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  74.07 
 
 		 217 aa  325  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  54.38 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  52.09 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  50.23 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  45.83 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  46.98 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  47.44 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  48.39 
 
 		 226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  46.51 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  46.51 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  46.05 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  45.58 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  41.9 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  43.26 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  46.76 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  44.65 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  46.3 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  43.32 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  43.32 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  42.59 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  42.13 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  48.61 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  41.4 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  40.74 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  42.99 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  40.98 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  40.93 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  40.95 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  40.57 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  39.15 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  42.52 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  41.31 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.07 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  40.74 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  41.86 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  41.67 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  41.23 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  41.86 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  42.18 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  41.86 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  41.86 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  41.86 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  38.14 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  39.81 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  41.4 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  36.92 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  44.65 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  44.65 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  44.65 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  44.65 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  44.65 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  43.6 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  37.96 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  39.15 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  36.11 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  42.65 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  44.67 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  37.5 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  42.25 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  36.98 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  37.04 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  35.71 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  46.15 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  45.6 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  33.81 
 
 		 214 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  35.71 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  37.41 
 
 		 141 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.38 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  27.69 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  28.96 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.05 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.05 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.05 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.74 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.76 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  46.27 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.81 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  31.73 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.41 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  27.92 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  26.32 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  26.39 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  31.76 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  22.65 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  29.6 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  47.76 
 
 		 76 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.37 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  30.16 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  40.58 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  28.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  28.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  28.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  28.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  28.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.48 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  25.17 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  30.07 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  29.61 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>