More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5241 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5241  inner-membrane translocator  100 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1370  ABC transporter, inner membrane subunit  99.03 
 
 		 308 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164625  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1358  ABC transporter, permease protein  74.5 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1167  inner-membrane translocator  76.63 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  63.64 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  64.86 
 
 		 310 aa  391  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  65.2 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  65.2 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1703  inner-membrane translocator  66.67 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.209292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  66.33 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1115  inner-membrane translocator  66 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0272  inner-membrane translocator  63 
 
 		 307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5656  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  64.86 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  59.8 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0767  inner-membrane translocator  61.97 
 
 		 305 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0432903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0838  inner-membrane translocator  64.43 
 
 		 307 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  36.67 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.69 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  36.72 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  38.05 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  38.05 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  33.56 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  36.04 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  35.37 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  32 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  32.32 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  32.55 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  31.65 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  32.86 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>