More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1893 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  94.44 
 
 		 378 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  765    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  77.63 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  78.84 
 
 		 378 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  66.4 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  55.65 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 371 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 385 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 390 aa  345  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  52.12 
 
 		 374 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 		 374 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 		 374 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  52.34 
 
 		 376 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  48.71 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  47.66 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  52.3 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  47.47 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  45.98 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  45.27 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  44.16 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  43.32 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  42.74 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  47.52 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  40 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 983 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 390 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 984 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.06 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.89 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.7 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.78 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.5 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.5 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.92 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.92 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.21 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.5 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.37 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.63 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.37 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.09 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.37 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.51 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.51 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  26.04 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  26.04 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  26.04 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  26.8 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.04 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.27 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.27 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.29 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.76 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.47 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.39 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.49 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 500 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.91 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.07 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 500 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 496 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.95 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.99 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  23.96 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 960 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>