More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0245 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  100 
 
 		 333 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  42.26 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  42.26 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  42.26 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  42.26 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  47.4 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  46.75 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  41.78 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0713  phage integrase  40.54 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  38.6 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  38.6 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  38.6 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  38.6 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  38.6 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  38.6 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  39.88 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  37.8 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  40.91 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  38.44 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  37.98 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  38.92 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  38.92 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  38.92 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  38.44 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  38.14 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  39.39 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0440  phage integrase  39.39 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  38.74 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  40.07 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  39 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  39 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  32.64 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  37.27 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  36.5 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  36.47 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  30.54 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  36.33 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8259  integrase/recombinase  38.46 
 
 		 246 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  29.52 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2281  integrase domain-containing protein  37.88 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  31.76 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.01 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.44 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30.35 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.09 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.89 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.39 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.9 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  29.71 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.91 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.83 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  29.01 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  31.49 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.98 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  27.08 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  26.81 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  30.31 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.44 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  30.72 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.23 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.66 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.16 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.25 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  29.1 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 296 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.36 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  28.94 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.34 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31.96 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.83 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.23 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>