143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7609 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1419    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  48.43 
 
 		 579 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  42.35 
 
 		 694 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  42.35 
 
 		 694 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  42.35 
 
 		 694 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  42.35 
 
 		 694 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  42.35 
 
 		 694 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  41.59 
 
 		 694 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  42.54 
 
 		 829 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  40.09 
 
 		 692 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  36.35 
 
 		 722 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  35.25 
 
 		 689 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  35.94 
 
 		 685 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 		 689 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 		 689 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  33.92 
 
 		 689 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  33.92 
 
 		 689 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  33.92 
 
 		 689 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 656 aa  317  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 		 689 aa  301  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  32.99 
 
 		 617 aa  278  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  37.8 
 
 		 385 aa  203  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  37.8 
 
 		 385 aa  203  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  46.06 
 
 		 184 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  36.11 
 
 		 153 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.92 
 
 		 606 aa  87.8  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.92 
 
 		 606 aa  87.8  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.33 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  43.43 
 
 		 125 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  26.26 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.99 
 
 		 528 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.99 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  29.49 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.14 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.04 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.79 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.75 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.48 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.18 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.48 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.37 
 
 		 447 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.33 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.13 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.42 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.21 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.3 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.93 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.48 
 
 		 537 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.49 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.37 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.3 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.96 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.4 
 
 		 484 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  20.78 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  24.15 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.2 
 
 		 475 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  20.94 
 
 		 522 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.13 
 
 		 540 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  23.4 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  25.55 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  19.6 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  25.6 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.69 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  23.06 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  22.54 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.8 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  20.38 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.86 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  23.28 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.64 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  22.87 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.46 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  22.11 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  25.71 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  21.16 
 
 		 523 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.89 
 
 		 496 aa  57  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  22.86 
 
 		 531 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.93 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.24 
 
 		 515 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.03 
 
 		 519 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.9 
 
 		 524 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.35 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  20.98 
 
 		 543 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  20.45 
 
 		 552 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  20.56 
 
 		 523 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  21.6 
 
 		 526 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.64 
 
 		 494 aa  54.3  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  31.45 
 
 		 547 aa  54.3  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  22.49 
 
 		 612 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  19.49 
 
 		 522 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  18.61 
 
 		 520 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.02 
 
 		 504 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.92 
 
 		 525 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>