More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6355 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6355  porin  100 
 
 		 398 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  65.25 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  65.52 
 
 		 374 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  65.34 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  63.93 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  63.93 
 
 		 375 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  63.93 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  63.93 
 
 		 379 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  63.93 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  63.93 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  34.64 
 
 		 356 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  33.58 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  33.58 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  33.58 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  33.25 
 
 		 355 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  33.16 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  34 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  32.75 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  34.29 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  34.16 
 
 		 351 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  31.83 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  32.91 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  31.22 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  30.26 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  30.26 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  30.23 
 
 		 360 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  29.61 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  33.59 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  33.59 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  29.69 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6216  porin  28.54 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  29.28 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  31.35 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  31.35 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  28.5 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.75 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.22 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.02 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.02 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1354  porin  30.39 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  30.61 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  28.26 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  31.33 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  30.58 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  28.61 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  30.08 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  31.86 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.19 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  31.08 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  31.44 
 
 		 354 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  32.71 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  32.71 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  32.71 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.08 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  27.12 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  32.71 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  32.71 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  32.71 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  32.71 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.46 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  32.71 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  29.82 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  29.82 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  29.97 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  29.57 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  29.97 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  29.97 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  29.26 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  29.32 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  26.94 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  26.94 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.2 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  27.85 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  28.39 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  28.93 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  29.43 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  29.02 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  29.19 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  27.34 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  28.86 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  26.87 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  29.02 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  30.73 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.92 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  30.46 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.08 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.27 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  29.77 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  27.82 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  29.77 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  30.84 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.5 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  29.43 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  29.3 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  29.95 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>