More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2886 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  45.74 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  43.6 
 
 
390 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  46.88 
 
 
383 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  46.35 
 
 
384 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  46.01 
 
 
381 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  44 
 
 
378 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 
381 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.3 
 
 
381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  42.29 
 
 
385 aa  318  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  43.92 
 
 
387 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  45.21 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  44.47 
 
 
394 aa  312  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.43 
 
 
390 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  40.94 
 
 
394 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  44.92 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  45.5 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  43.05 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  43.09 
 
 
378 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  45.71 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  45.97 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  40.67 
 
 
399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.51 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  44.47 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  44.12 
 
 
393 aa  302  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  44.13 
 
 
390 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  43.01 
 
 
387 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  41.49 
 
 
396 aa  296  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  42.33 
 
 
382 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  41.95 
 
 
377 aa  292  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  43.44 
 
 
387 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 
389 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  42.04 
 
 
380 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  40.74 
 
 
377 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  47.89 
 
 
390 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  38.13 
 
 
396 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  40.63 
 
 
373 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  43.95 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.06 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  40.63 
 
 
393 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  39.26 
 
 
395 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  40.81 
 
 
376 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  44.3 
 
 
364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  38.58 
 
 
377 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  40.56 
 
 
407 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  39.01 
 
 
378 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.01 
 
 
377 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  34.48 
 
 
381 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
373 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  38.22 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  38.48 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  38.48 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.74 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.47 
 
 
388 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  38.22 
 
 
390 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  38.05 
 
 
389 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.3 
 
 
390 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  37.96 
 
 
390 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.7 
 
 
390 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.37 
 
 
389 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  38.18 
 
 
390 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  37.85 
 
 
390 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
364 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
392 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
375 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.42 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
384 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.57 
 
 
383 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
381 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
383 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
381 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.3 
 
 
366 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
374 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 
380 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.73 
 
 
382 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.79 
 
 
386 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 
382 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  34.6 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.83 
 
 
382 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
377 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 
380 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
396 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 
370 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
387 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.43 
 
 
379 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
390 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.07 
 
 
348 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>