More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2737 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 723 aa  1474    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  40.54 
 
 		 543 aa  283  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  35.94 
 
 		 410 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  35.28 
 
 		 404 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  35.38 
 
 		 411 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  36.91 
 
 		 399 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  35 
 
 		 412 aa  227  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  32.19 
 
 		 409 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  31.67 
 
 		 402 aa  214  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  34.81 
 
 		 405 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  34.65 
 
 		 411 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.05 
 
 		 756 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  29.56 
 
 		 395 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.37 
 
 		 405 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.32 
 
 		 420 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.06 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  26.26 
 
 		 398 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  28.45 
 
 		 437 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.13 
 
 		 418 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.56 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.79 
 
 		 425 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.25 
 
 		 407 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.25 
 
 		 407 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  25.25 
 
 		 404 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.52 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  23.8 
 
 		 428 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.92 
 
 		 410 aa  99.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.05 
 
 		 432 aa  98.6  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1075  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  27.68 
 
 		 339 aa  97.1  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.14 
 
 		 409 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.73 
 
 		 411 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.29 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  27.04 
 
 		 410 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26.25 
 
 		 424 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  24.93 
 
 		 414 aa  94.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.17 
 
 		 416 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  25.9 
 
 		 424 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  25.9 
 
 		 424 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.63 
 
 		 900 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.63 
 
 		 914 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.63 
 
 		 900 aa  91.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1257  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  23.51 
 
 		 340 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  23.62 
 
 		 419 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.96 
 
 		 411 aa  87.8  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  25.81 
 
 		 373 aa  87  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.43 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  23.48 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.61 
 
 		 423 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.54 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  27.64 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1844  hydroxyacid oxidase 2  24.15 
 
 		 340 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2132  FMN-dependent dehydrogenase  24.3 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2031  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  24.3 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.268129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  26.13 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  23.78 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  23.78 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  23.78 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  30.13 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1976  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  24.35 
 
 		 338 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.27 
 
 		 1110 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.27 
 
 		 1060 aa  67.4  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.96 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.29 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.32 
 
 		 1496 aa  66.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0320  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.76 
 
 		 1078 aa  66.6  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000336143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  25.5 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  23.02 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0421614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.07 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.68 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1204  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  23.4 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.67 
 
 		 1073 aa  64.7  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0157  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  24.03 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  23.46 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  25.79 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  22.82 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.76 
 
 		 1071 aa  63.9  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 926 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 904 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 896 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1064 aa  63.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 894 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 924 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 904 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.89 
 
 		 1059 aa  63.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.09 
 
 		 1093 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.13 
 
 		 1072 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  22.38 
 
 		 912 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.53 
 
 		 1072 aa  62.4  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0437  D-alanine/D-alanine ligase  27.83 
 
 		 345 aa  62  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  25.81 
 
 		 333 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3743  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.17 
 
 		 1112 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0558638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.14 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1462  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  22.96 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0238326  normal  0.034718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.24 
 
 		 1074 aa  60.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.98 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.98 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  27.51 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2405  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.43 
 
 		 1099 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  22.43 
 
 		 891 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>