More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1844 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2132  FMN-dependent dehydrogenase  98.82 
 
 
340 aa  671    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1844  hydroxyacid oxidase 2  100 
 
 
340 aa  681    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1257  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  56.97 
 
 
340 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1075  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  56.02 
 
 
339 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1976  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  49.7 
 
 
338 aa  349  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0750  FMN-dependent family dehydrogenase  50.3 
 
 
340 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0528  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  49.26 
 
 
341 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1204  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.89 
 
 
339 aa  329  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0157  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.45 
 
 
336 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  47.73 
 
 
407 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0421614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2031  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.95 
 
 
336 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.268129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2319  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.24 
 
 
337 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2255  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.24 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.63 
 
 
389 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1462  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.71 
 
 
352 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0238326  normal  0.034718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  29.86 
 
 
371 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0378  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.88 
 
 
371 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0702  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.09 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0859  hypothetical protein  33 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.64 
 
 
349 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0123  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.2 
 
 
295 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.895789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.44 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4676  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.5 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00322368  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2560  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.2 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4251  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  48.25 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.731612  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  30.79 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  46.41 
 
 
388 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3049  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  28.74 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2274  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  30.79 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0839  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.72 
 
 
361 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.48 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0905  Lactate 2-monooxygenase  28.98 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.34 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  44.94 
 
 
378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  48 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4523  Lactate 2-monooxygenase  28.31 
 
 
426 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  43.95 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3608  L-lactate dehydrogenase  41.25 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  44.59 
 
 
379 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  48.59 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  48.59 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  29.41 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  48.92 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  48.59 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  47.33 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  30.37 
 
 
395 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  47.33 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  46 
 
 
395 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
386 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3083  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  28.27 
 
 
395 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.796124  normal  0.594065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  46 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  46 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  46 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  46 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  46.48 
 
 
396 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  46 
 
 
396 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  45.07 
 
 
392 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02080  hypothetical protein  30.58 
 
 
370 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  44.08 
 
 
381 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  44.08 
 
 
381 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  44.08 
 
 
381 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  41.77 
 
 
379 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1864  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) related alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.59 
 
 
417 aa  123  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.213677  hitchhiker  0.000000000554071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.65 
 
 
395 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.97 
 
 
388 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  42.68 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  42.68 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  28.13 
 
 
440 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1699  Lactate 2-monooxygenase  42.22 
 
 
434 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD1  44.29 
 
 
396 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.72 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  32.26 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5439  L-lactate dehydrogenase  48.92 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.36 
 
 
391 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1002  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  45 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1029  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  45 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918253  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1019  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  45 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26668  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.14 
 
 
395 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1466  Lactate 2-monooxygenase  28.21 
 
 
396 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.29 
 
 
435 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.53 
 
 
379 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0453  Lactate 2-monooxygenase  38.03 
 
 
361 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08744  FMN dependent dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02720)  27.09 
 
 
403 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  39.74 
 
 
381 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.42 
 
 
397 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1297  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  43.57 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0902031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13410  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  28.86 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.74 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  41.1 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>