More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
371 aa  730    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.73 
 
 
389 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0378  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  65.01 
 
 
371 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0702  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  65.68 
 
 
369 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2560  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  59.89 
 
 
396 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3049  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  58.27 
 
 
379 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3083  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  58.06 
 
 
395 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.796124  normal  0.594065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0839  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  59.09 
 
 
361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4620  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  58.38 
 
 
393 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.609739  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4676  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  58.5 
 
 
363 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00322368  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2274  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  50.55 
 
 
369 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.43 
 
 
349 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.42 
 
 
359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1462  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.38 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0238326  normal  0.034718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  49.31 
 
 
391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  48.31 
 
 
366 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  48.24 
 
 
358 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  47.32 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.35 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0513  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.78 
 
 
365 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0367469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0496  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  47.12 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150259  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0529  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  47.06 
 
 
375 aa  259  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  36.32 
 
 
500 aa  255  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2905  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.78 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0229  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.86 
 
 
364 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02080  hypothetical protein  39.4 
 
 
370 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4107  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.96 
 
 
385 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  41.44 
 
 
384 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2130  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  47.06 
 
 
343 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.559248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  38.61 
 
 
378 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  36.87 
 
 
386 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.14 
 
 
401 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  37.93 
 
 
386 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 
379 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  37.53 
 
 
392 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2057  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  43.91 
 
 
370 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  36.24 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.11 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0905  Lactate 2-monooxygenase  42.3 
 
 
388 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.2 
 
 
379 aa  237  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4034  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.23 
 
 
373 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.7 
 
 
381 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  38.03 
 
 
379 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 
379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.08 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  36.46 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4408  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.27 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.96 
 
 
381 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1466  Lactate 2-monooxygenase  43.09 
 
 
396 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1989  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.44 
 
 
386 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2035  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.44 
 
 
386 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162743  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  37.67 
 
 
394 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 
381 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 
381 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 
381 aa  232  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  33.78 
 
 
381 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 
379 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3265  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  43.9 
 
 
678 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4136  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.95 
 
 
386 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.71733  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  32.98 
 
 
390 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1969  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.91 
 
 
386 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2401  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.51 
 
 
391 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.22 
 
 
379 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
381 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
381 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.78 
 
 
380 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22568  glycolate oxidase  41.21 
 
 
381 aa  227  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.708918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.96 
 
 
406 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.07 
 
 
388 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.81 
 
 
406 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  37.53 
 
 
388 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  37.67 
 
 
381 aa  225  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 
378 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.85 
 
 
378 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.57 
 
 
389 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.33 
 
 
376 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.41 
 
 
382 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  36.75 
 
 
396 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.89 
 
 
381 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1052  lactate 2-monooxygenase  37.97 
 
 
431 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  37.3 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  38.81 
 
 
409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.32 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  37.84 
 
 
412 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  37.84 
 
 
412 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  37.84 
 
 
412 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  37.84 
 
 
440 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  37.84 
 
 
440 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  36.48 
 
 
396 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 
381 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 
396 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>