More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03463 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  100 
 
 
396 aa  806    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  806    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  84.74 
 
 
381 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  85.79 
 
 
381 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  84.74 
 
 
381 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  806    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  84.21 
 
 
381 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  83.2 
 
 
381 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  84.08 
 
 
379 aa  664    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  84.21 
 
 
381 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  83.81 
 
 
386 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  806    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  93.69 
 
 
396 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  806    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  92.68 
 
 
395 aa  739    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  82.01 
 
 
392 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  94.19 
 
 
396 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  98.74 
 
 
396 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  83.2 
 
 
381 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  99.75 
 
 
396 aa  805    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  79.58 
 
 
379 aa  634    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  93.69 
 
 
396 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  93.69 
 
 
396 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  94.19 
 
 
396 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  81.72 
 
 
386 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  99.75 
 
 
396 aa  805    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  86.32 
 
 
381 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  83.2 
 
 
381 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  82.26 
 
 
388 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  82.23 
 
 
379 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  85.68 
 
 
379 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3855  L-lactate dehydrogenase  84.96 
 
 
380 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  78.51 
 
 
378 aa  623  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  78.78 
 
 
378 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  76.42 
 
 
388 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5439  L-lactate dehydrogenase  77.31 
 
 
379 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  71.77 
 
 
380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3608  L-lactate dehydrogenase  67.37 
 
 
380 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  64.47 
 
 
384 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  63.23 
 
 
381 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  48.05 
 
 
395 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.53 
 
 
383 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.53 
 
 
400 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.93 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.92 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.89 
 
 
379 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.92 
 
 
380 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.36 
 
 
379 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.01 
 
 
379 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  47.04 
 
 
381 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  47.04 
 
 
381 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  47.04 
 
 
381 aa  346  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.6 
 
 
379 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.72 
 
 
378 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.84 
 
 
380 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.39 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.95 
 
 
381 aa  339  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.58 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.47 
 
 
385 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.8 
 
 
405 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.42 
 
 
387 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.59 
 
 
383 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.65 
 
 
391 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.13 
 
 
397 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  45.55 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.06 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.78 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.65 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.53 
 
 
402 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  43.39 
 
 
383 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.98 
 
 
403 aa  327  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.22 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  42.86 
 
 
383 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.22 
 
 
383 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.49 
 
 
386 aa  323  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.39 
 
 
385 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 
390 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.59 
 
 
390 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.29 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.22 
 
 
387 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  42.33 
 
 
390 aa  319  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.33 
 
 
387 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.6 
 
 
390 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.32 
 
 
394 aa  314  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.17 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.38 
 
 
387 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  41.38 
 
 
387 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1643  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  47.55 
 
 
395 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.33 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2872  putative L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2990  putative L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1563  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0415  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.596015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0374  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0688982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1750  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1229  L-lactate dehydrogenase  42.02 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0499523  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0468  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.21 
 
 
390 aa  298  9e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000798916  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5062  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.91 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  40.38 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>