More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1297 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5059  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  92.31 
 
 
391 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1029  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  84.1 
 
 
397 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918253  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1002  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  84.1 
 
 
397 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1019  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  84.1 
 
 
397 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1297  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  100 
 
 
391 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0902031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD1  79.59 
 
 
396 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0776  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  73.71 
 
 
393 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3777  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  69.82 
 
 
407 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2361  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  67.61 
 
 
393 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3205  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  69.77 
 
 
394 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.901483  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3151  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  64.18 
 
 
400 aa  508  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0698274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0573  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  67.28 
 
 
389 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2980  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  61.15 
 
 
402 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.79 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.46 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  36 
 
 
381 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  36 
 
 
390 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  38.5 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  37.98 
 
 
383 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.37 
 
 
399 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.41 
 
 
381 aa  229  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.87 
 
 
380 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.63 
 
 
391 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.17 
 
 
380 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.8 
 
 
381 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.6 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.59 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 
390 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.97 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.88 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.34 
 
 
406 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.68 
 
 
382 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.94 
 
 
383 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.41 
 
 
359 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.36 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.41 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.54 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0085  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.49 
 
 
382 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.28 
 
 
379 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.17 
 
 
390 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.68 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.17 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.27 
 
 
385 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  35.29 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.66 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.63 
 
 
397 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.14 
 
 
378 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.16 
 
 
379 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.19 
 
 
381 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.19 
 
 
381 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.19 
 
 
381 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1619  Lactate 2-monooxygenase  38.36 
 
 
389 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00855428  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  34.82 
 
 
386 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.88 
 
 
385 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  34.77 
 
 
386 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.47 
 
 
387 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  34.83 
 
 
381 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.9 
 
 
383 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  34.83 
 
 
381 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.74 
 
 
379 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.91 
 
 
387 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 
381 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.63 
 
 
366 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 
381 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 
381 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.81 
 
 
396 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.75 
 
 
387 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.03 
 
 
409 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.55 
 
 
387 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.04 
 
 
379 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1831  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.05 
 
 
390 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  35.6 
 
 
381 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  33.78 
 
 
387 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 
387 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  34.56 
 
 
390 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.02 
 
 
381 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  33.96 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1172  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.51 
 
 
394 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  33.96 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.59 
 
 
358 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  34.84 
 
 
431 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.22 
 
 
388 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20471  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases  35.51 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.819941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
378 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.62 
 
 
403 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  37.2 
 
 
412 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  37.2 
 
 
440 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  37.2 
 
 
440 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  37.2 
 
 
412 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  37.2 
 
 
412 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>