More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5250 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  83.2 
 
 
381 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  81.89 
 
 
382 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0085  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  83.2 
 
 
382 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  84.74 
 
 
381 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  100 
 
 
381 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
381 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  100 
 
 
381 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  75.07 
 
 
382 aa  627  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  65.88 
 
 
385 aa  538  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  56.81 
 
 
382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  42.48 
 
 
381 aa  345  8.999999999999999e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  40.81 
 
 
431 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 
409 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  38.58 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.55 
 
 
410 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.36 
 
 
381 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  37.87 
 
 
383 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.32 
 
 
403 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  37.87 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
422 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.2 
 
 
381 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.64 
 
 
380 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.34 
 
 
390 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.83 
 
 
388 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
381 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
381 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
417 aa  259  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.27 
 
 
397 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  37.6 
 
 
412 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.25 
 
 
417 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  37.6 
 
 
412 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  37.6 
 
 
412 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  37.6 
 
 
412 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.27 
 
 
440 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  37.6 
 
 
440 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  37.6 
 
 
440 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4670  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.8 
 
 
418 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.64 
 
 
380 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  37.34 
 
 
440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.73 
 
 
359 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.78 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  36.96 
 
 
386 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.04 
 
 
381 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.17 
 
 
458 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 
385 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.05 
 
 
399 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0579  FMN-dependent dehydrogenase  38.48 
 
 
412 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.39 
 
 
386 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.33 
 
 
406 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.16 
 
 
415 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.43 
 
 
405 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.57 
 
 
370 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.53 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.61 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.12 
 
 
391 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  38.32 
 
 
381 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 
390 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.05 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.21 
 
 
383 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.66 
 
 
387 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37603  predicted protein  37.37 
 
 
398 aa  243  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  35.77 
 
 
420 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  36.46 
 
 
414 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.5 
 
 
381 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.66 
 
 
391 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  34.93 
 
 
390 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.96 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.41 
 
 
390 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.69 
 
 
381 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.41 
 
 
390 aa  239  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.14 
 
 
378 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.9 
 
 
401 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  34.13 
 
 
387 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.13 
 
 
387 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.16 
 
 
385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0374  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0688982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1229  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0499523  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1563  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0415  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.596015  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1750  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2990  putative L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181146  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2872  putative L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
380 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.97 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.61 
 
 
379 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.15 
 
 
387 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.97 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.13 
 
 
387 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.7 
 
 
402 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
394 aa  233  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.74 
 
 
400 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.23 
 
 
395 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  33.42 
 
 
390 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.06 
 
 
379 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.88 
 
 
387 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2401  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.26 
 
 
391 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.35 
 
 
379 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  38.11 
 
 
380 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0468  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.03 
 
 
390 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000798916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>