More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1831 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1831  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 390 aa  801    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  44.91 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.52 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  44.29 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0668  (S)-mandelate dehydrogenase  46.07 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0579  FMN-dependent dehydrogenase  40.16 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  38.5 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  38.5 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.56 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  38.24 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  38.58 
 
 		 412 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.58 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  38.58 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  38.58 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  38.58 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.22 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.11 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.44 
 
 		 401 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.05 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.69 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  40.47 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  41.3 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.66 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  40.26 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  40.26 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.53 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  40.26 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  40.75 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.92 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.42 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.95 
 
 		 381 aa  259  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  40.05 
 
 		 386 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.37 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  39.37 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  38.32 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.89 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  39.37 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.85 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.27 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.58 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.52 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.21 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.57 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.65 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.68 
 
 		 390 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.73 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  37.73 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.68 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.74 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.63 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.3 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.73 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.35 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.87 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.76 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  37.24 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.3 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.2 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6402  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.68 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0468  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.6 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000798916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.55 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.19 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.19 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.23 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.26 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  38.61 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  39.95 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.94 
 
 		 387 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  39.68 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.34 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.08 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  39.68 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  38.61 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  38.61 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  38.61 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  35.06 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  38.5 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  38.83 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  35.36 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  38.61 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.21 
 
 		 372 aa  239  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5439  L-lactate dehydrogenase  38.93 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.67 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  39.39 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  38.03 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  39.42 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.81 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>