More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3845 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  100 
 
 
397 aa  797    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0668  (S)-mandelate dehydrogenase  67.18 
 
 
391 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.35 
 
 
415 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  52.62 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1831  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.91 
 
 
390 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  47.11 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.51 
 
 
357 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.95 
 
 
409 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.8 
 
 
359 aa  269  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  40.21 
 
 
418 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.8 
 
 
394 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.19 
 
 
401 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  38.16 
 
 
381 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.73 
 
 
403 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.38 
 
 
379 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
381 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  38.62 
 
 
409 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.6 
 
 
399 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.65 
 
 
379 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.23 
 
 
379 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.15 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.06 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.92 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.05 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0468  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.49 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000798916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.6 
 
 
417 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.07 
 
 
380 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.46 
 
 
385 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.65 
 
 
385 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.39 
 
 
383 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.04 
 
 
410 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.41 
 
 
390 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.97 
 
 
422 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.84 
 
 
405 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.03 
 
 
378 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.12 
 
 
391 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 
391 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  37.4 
 
 
431 aa  245  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.06 
 
 
397 aa  246  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.92 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.4 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.53 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.43 
 
 
410 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.43 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  37.47 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.27 
 
 
381 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.47 
 
 
380 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.69 
 
 
389 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.21 
 
 
378 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  38.95 
 
 
384 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.37 
 
 
440 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.44 
 
 
411 aa  242  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.02 
 
 
403 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 
386 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.15 
 
 
458 aa  241  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  37.37 
 
 
378 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.34 
 
 
435 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.32 
 
 
431 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  37.87 
 
 
383 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.77 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  37.6 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.81 
 
 
381 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  37.95 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  37.95 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.87 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.59 
 
 
406 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.84 
 
 
387 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.7 
 
 
388 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 
390 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  39.42 
 
 
414 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.46 
 
 
414 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.4 
 
 
390 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.87 
 
 
406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.7 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.84 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 
381 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 
381 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 
381 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.83 
 
 
388 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  36.66 
 
 
392 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36 
 
 
385 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  34.78 
 
 
392 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  35.73 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.5 
 
 
358 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  35.08 
 
 
387 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  35.73 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.08 
 
 
387 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.17 
 
 
379 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4877  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.87 
 
 
379 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.414226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  36.32 
 
 
379 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.18 
 
 
391 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  36.75 
 
 
390 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>