More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3343 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  91.22 
 
 
410 aa  776    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
417 aa  844    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.18 
 
 
409 aa  538  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.13 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  62.78 
 
 
414 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  65.6 
 
 
410 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.18 
 
 
422 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  57.28 
 
 
409 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.69 
 
 
411 aa  471  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.04 
 
 
403 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  58.97 
 
 
418 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  49.14 
 
 
427 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.73 
 
 
458 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.09 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.51 
 
 
440 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.82 
 
 
379 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.4 
 
 
386 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4670  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.61 
 
 
418 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.09 
 
 
379 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.35 
 
 
379 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.55 
 
 
381 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.16 
 
 
390 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.9 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  38.95 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.32 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.21 
 
 
403 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.05 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.84 
 
 
402 aa  281  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.58 
 
 
381 aa  279  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.31 
 
 
402 aa  279  8e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.16 
 
 
378 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.52 
 
 
406 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  40.92 
 
 
381 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  40.92 
 
 
381 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.75 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.61 
 
 
399 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.89 
 
 
380 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.76 
 
 
385 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.57 
 
 
381 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  39.57 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  39.57 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.89 
 
 
383 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.21 
 
 
388 aa  269  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.38 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.47 
 
 
391 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.75 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  42.11 
 
 
381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.78 
 
 
414 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  39.14 
 
 
431 aa  266  7e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.27 
 
 
385 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  40.48 
 
 
386 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  40.43 
 
 
392 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.94 
 
 
380 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  39.68 
 
 
390 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  41.51 
 
 
379 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.14 
 
 
405 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  40.21 
 
 
386 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.94 
 
 
401 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  37.83 
 
 
387 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.02 
 
 
379 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.83 
 
 
387 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 
381 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  40.11 
 
 
396 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.83 
 
 
387 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.03 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.21 
 
 
397 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.3 
 
 
400 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  39.68 
 
 
396 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  39.95 
 
 
386 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.33 
 
 
370 aa  256  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  41.53 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  41.53 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  41.53 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  38.83 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  39.41 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  40.74 
 
 
381 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  41.01 
 
 
381 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.68 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  38.34 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.25 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.25 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  40.43 
 
 
388 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.6 
 
 
397 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  40.37 
 
 
396 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5439  L-lactate dehydrogenase  38.34 
 
 
379 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  40.37 
 
 
396 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  40.37 
 
 
396 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  41.01 
 
 
381 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  38.13 
 
 
381 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>